宣战后的两个月时间中，风平浪静，虽然也有人怀疑开战的真实性，但高层们亲眼见过面具男诡异的能力，丝毫没有放松，反而因为两个月时间的缓冲，而得以喘息。
联军总部就设置在最大的炎魔竞技场中，十三个竞技场，外围还有大片新建的建筑，以及尚未建设的空地，有足够的空间容纳联军，同时，孤悬海外的水之国，有大海作为天然屏障，也能一定程度上保障总部的安全。
两个月时间，水之国的工匠们加班加点，在忍者们的帮助下，修建了九座跨海大桥，分别连接着雷之国和火之国，同时，各国的大名们也先后来到水之国避难，水之国高度发达的生活设施和度假村，让这些曾经自认为享受最好生活而不愿避难的大名们闭上了发牢骚的嘴。
“帮大忙了，水影，幸亏水之国的设施能让大名们满意，不然还真不好处理他们，一群只会吃米的蛀虫。”
艾在被改造成总部办公室的原炎魔竞技场VIp包房内，向其他几位影和助手发着牢骚，始料未及的阻碍，还没有造成问题，就已经被扫清了。
为了彰显忍界联合一体共抗强敌的决心，做的第一件事，就是更换护额。
写有“忍”字的护额，被分发到每一位忍者手中，从现在开始，所有忍者，都将属于忍者联军，按照联军指挥部的命令统一行事，而非原本以村子为单位。
联军中，自然有不少本就有仇的忍者，琴里将一大十二小的竞技场全部开放，有怨报怨有仇报仇，在不伤姓名的情况下，所有忍者都可以在这里进行一对一的决斗，但这之后，直到战斗结束之前，禁止一切形式的私斗！
联军主战部队被分为五支部队，分别是：
第一部队：中距离联合军分队；统领：达鲁伊。
第二部队：近战联合军分队；统领：黄土。
第三部队：中近距离机动联合军分队；统领：旗木卡卡西。
第四部队：远距离战斗联合军分队；统领：奈良鹿丸。
第五部队：战斗特别分队；统领：三船。
以上五大分队，为战斗中正面战场上对敌的部队，按照忍者的主攻能力进行划分。
除了五大主战部队外，还有五支后勤部队：
负责救助伤员的医疗后勤部队；统领：日向雏田。
负责感知敌人的感知部队；统领：希。
负责情报收发传达的情报部队；统领：山中亥一、青。
负责保护大名的大名护卫队；统领：照美冥、桃地再不斩。
负责奇袭试探的奇袭部队；统领：勘九郎、干沛鬼鲛、宇智波鼬、辉夜君麻吕。
五支主站，五支后勤，总共十支部队，共同构成了联军的总体框架，而在他们之上，作为联军首脑的，正是五影！
为了决定最高统帅的身份，除了主动退出的大野木、我爱罗两人，纲手、香织、艾三人展开了一场激战，最终香织胜出，成为联军最高统帅，并任命我爱罗为联军总队长，任命奈良鹿久、麻布衣、波风水门为联军参谋。
与忍者护额一同分发到每一位忍者手中的，还有一小盒药丸，这些，都是技术开发局最新的成果。
超级强体丸，能在十分钟内强化50%左右的力量，代价是之后的五十分钟内会变得乏力。